Contig

释义 Definition

contig（名词）：在基因组测序与组装中，由许多短序列（reads）通过重叠关系拼接而成的连续序列片段（通常指在没有空缺的情况下拼接出的较长 DNA 序列）。在实际组装结果中，contig 往往是构成更大结构（如 scaffold）的基础。

发音 Pronunciation

/ˈkɒn.tɪɡ/

例句 Examples

The assembly produced 120 contigs.
这次组装产生了120条 contig（连续序列片段）。

After filtering low-quality reads, we aligned the remaining sequences and merged overlaps to extend each contig, improving the genome’s continuity.
在过滤低质量 reads 后，我们对剩余序列进行比对并合并重叠区域以延长每条 contig，从而提升基因组的连续性。

词源 Etymology

contig 是 contiguous（“连续的”）的缩略形式，在生物信息学中被用作专门术语，强调“由重叠拼接得到的一段连续序列”。它的核心概念来自 contiguous 的拉丁语词根 contiguus，意为“接触的、相邻的”。

相关词 Related Words

• Assembly
• Scaffold
• Read
• Sequence
• Genome
• Alignment
• Overlap
• N50
• Contiguous
• De Novo

文学与著作中的用例 Literary Works

• Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis（David W. Mount）：在讲解基因组组装流程与评价指标时频繁使用 contig。
• Genome Assembly and Annotation（相关教材/编著卷册常见标题）：在描述从 reads 到 contigs/scaffolds 的组装层级时使用 contig。
• Nature、Science、Genome Research 等期刊的基因组论文：在报告组装质量（如 contig 数量、contig N50）和组装方法时常出现 contig。